冻干机的选型要有一个思路，比如先确定是应用于哪个行业，然后再确定需要的容量。 实验系列的冻干机用于研发之用，冷阱的结冰量每批次一般都是低于6公斤，干燥室的板层面积小于0.2平方米。
中试及小规模生产系列用于中试模拟冻干工艺及小批量生产之用，冷阱的结冰量每批次一般都在6~25公斤之间，干燥室的板层面积在 0.2~0 平方米之间。
工业生产系列的冻干机用于工厂大规模生产之用，冷阱的结冰量每批次在40公斤以上，甚至有些达到1000公斤以上，而干燥室的板层面积在2平米以上，甚至有些达到100平方米左右。
一般可以参考冻干机的板层面积即盘装法和瓶装法。盘装法充分利用了板层面积，而瓶装法由于瓶之间的间隙未充分利用，所需的板层面积较大。下面按盘装和瓶装两种工艺分别予以计算：
1. 盘装法
每盘的装载高度为10毫米（为保证冻干效果和速度，盘装液体建议高度不超过10mm），则10 公斤(升)的液体所需的板层面积为：
A(面积，m2) = V(容积，m3) ÷ H(高度，m) = 0.01 m3÷0.01m = 1 m2
即需选用板层面积为1m2的冻干机，再查一下1m2冻干机的冷阱的结冰量是否能承受10公斤(升)的能力，如果满足要求，就可以选定该种型号的冻干机。
按照这些信息进行选型，例如快乐飞艇的冻干机，就可以选择CTFD-100S或者CTFD-100T型号。
2.瓶装法
使用的瓶子为国产20ml西林瓶(直径为22mm，高度为 50mm)，每瓶内的装量为 5ml，例如某用户要冻干1000支20ml西林瓶。选型方法如下：
计算干燥室的板层面积：A(面积，m2) = a(每瓶占用面积 m2) × N(总瓶数) = 3.14 ×(0.011×0.011) × 1000 = 0.38 m2
考虑圆瓶子之间的间隙所占有空间，因此实际占用面积比上述计算面积要大，大致可除上一个系数0.9。即：0.38 ÷ 0.9 = 0.42 m2。可选用板层面积为0.42~0.5平方米的冻干机。
再算一下大含水量，5ml*1000支=5L（5kg）。
此外，该用户需要冻干的是西林瓶，需要压塞功能。
按照这些信息进行选型，例如快乐飞艇的冻干机，就可以有多种型号选择。
