真空冷冻干燥机适用于高档原料药，中药饮片，生物，野生蔬菜，脱水蔬菜、食品、水果、化工、药物中间体等物料的干燥。冷冻真空干燥是真空冷冻干燥机将制冷系统，真空系统，导热油加热系统，排湿系统组合一体，推出的一种新型箱体结构，较大地利用箱体内存放物料空间进行干燥的冷冻真空干燥。真空冷冻干燥机的冻干程序是：对物料冻干之前，要把需要冻干的产品分装在合适的容器内，一般是玻瓶或安瓶，装料要均匀，装载的物料表面尽量大，厚度尽量薄些，一般是10-15mm；然后放入与冻干箱尺寸相适应的金属盘内。
装箱之前，先将真空冷冻干燥机的冻干箱进行空箱降温，然后将产品放入冻干箱内进行预冻，抽真空之前要根据冷凝器冷冻机的降温速度提前使冷凝器工作，抽真空时冷凝器应达到-40℃左右的温度，待真空度达到一定数值后（通常应达到100uHg以上的真空度），即可对箱内产品进行加热。
一般加热分两步进行：第一步加温不使产品的温度超过共熔点的温度；待产品内水份基本干完后进行第二步加温，这时可迅速地使产品上升到规定的最高温度。在最高温度保持数小时后，即可结束冻干，冷冻干燥机冻干结束后，要注意先放干燥无菌的空气进入干燥箱，然后尽快地进行加塞封口，以防重新吸收空气中的水份。
